Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Htatsf1Q8BGC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Htatsf1Q8BGC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Htatsf1Q8BGC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms