Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap100Q80VN0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfap100Q80VN0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap100Q80VN0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms