Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube3cQ80U95 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ube3cQ80U95 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ube3cQ80U95 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.1 ms