Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnf1Q7TSH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnf1Q7TSH7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms