Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccp110Q7TSH4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccp110Q7TSH4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccp110Q7TSH4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms