Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg1bQ7TSF1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dsg1bQ7TSF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dsg1bQ7TSF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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