Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Letm2Q7TNU7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Letm2Q7TNU7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms