Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cyfip1Q7TMB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyfip1Q7TMB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyfip1Q7TMB8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms