Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mvb12aQ78HU3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mvb12aQ78HU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mvb12aQ78HU3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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