Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme8Q715T0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nme8Q715T0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme8Q715T0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms