Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h4Q6ZPZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h4Q6ZPZ3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms