Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LcorQ6ZPI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LcorQ6ZPI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LcorQ6ZPI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms