Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcp4l1Q6W8Q3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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