Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cxcl3Q6W5C0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cxcl3Q6W5C0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms