Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcaf3Q6QR59 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcaf3Q6QR59 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcaf3Q6QR59 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms