Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx13Q6PHS6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx13Q6PHS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms