Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad54bQ6PFE3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54bQ6PFE3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54bQ6PFE3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms