Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf1cQ6PDZ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf1cQ6PDZ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Taf1cQ6PDZ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf1cQ6PDZ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf1cQ6PDZ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf1cQ6PDZ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf1cQ6PDZ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms