Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak2Q6P9N8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trak2Q6P9N8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms