Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nrxn3Q6P9K9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nrxn3Q6P9K9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nrxn3Q6P9K9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms