Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg2aQ6P4T0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atg2aQ6P4T0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg2aQ6P4T0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms