Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KdsrQ6GV12 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KdsrQ6GV12 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KdsrQ6GV12 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KdsrQ6GV12 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KdsrQ6GV12 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KdsrQ6GV12 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KdsrQ6GV12 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms