Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Carmil1Q6EDY6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Carmil1Q6EDY6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Carmil1Q6EDY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Carmil1Q6EDY6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Carmil1Q6EDY6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms