Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Spty2d1Q68FG3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spty2d1Q68FG3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spty2d1Q68FG3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms