Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PtprcapQ64697 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprcapQ64697 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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PtprcapQ64697 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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PtprcapQ64697 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprcapQ64697 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprcapQ64697 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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PtprcapQ64697 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprcapQ64697 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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PtprcapQ64697 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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PtprcapQ64697 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprcapQ64697 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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