Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr2e1Q64104 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr2e1Q64104 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2e1Q64104 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms