Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp248Q640N4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp248Q640N4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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