Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PatjQ63ZW7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PatjQ63ZW7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PatjQ63ZW7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms