Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn4Q62472 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lcn4Q62472 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lcn4Q62472 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1000.2 ms