Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga3Q62470 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga3Q62470 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms