Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vat1Q62465 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vat1Q62465 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vat1Q62465 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms