Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha6Q62413 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha6Q62413 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Epha6Q62413 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha6Q62413 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha6Q62413 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha6Q62413 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms