Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim28Q62318 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim28Q62318 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim28Q62318 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim28Q62318 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trim28Q62318 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim28Q62318 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim28Q62318 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms