Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema3cQ62181 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3cQ62181 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3cQ62181 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3cQ62181 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema3cQ62181 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3cQ62181 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms