Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm1Q61508 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecm1Q61508 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms