Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccna1Q61456 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccna1Q61456 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccna1Q61456 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms