Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf235Q61116 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf235Q61116 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf235Q61116 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms