Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Papss1Q60967 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Papss1Q60967 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms