Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kpna1Q60960 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna1Q60960 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna1Q60960 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms