Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk2a1Q60737 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a1Q60737 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms