Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CttnQ60598 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CttnQ60598 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CttnQ60598 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CttnQ60598 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CttnQ60598 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CttnQ60598 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CttnQ60598 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CttnQ60598 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms