Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USPL1Q5W0Q7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USPL1Q5W0Q7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USPL1Q5W0Q7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USPL1Q5W0Q7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms