Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uimc1Q5U5Q9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uimc1Q5U5Q9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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