Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mks1Q5SW45 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms