Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL6

Rap1gap2, Rap1 GTPase-activating protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1gap2Q5SVL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rap1gap2Q5SVL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rap1gap2Q5SVL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rap1gap2Q5SVL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms