Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam71bQ5STT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms