Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PkdccQ5RJI4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PkdccQ5RJI4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PkdccQ5RJI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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