Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd1Q5M956 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kctd1Q5M956 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kctd1Q5M956 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms