Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trpm3Q5F4S9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm3Q5F4S9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm3Q5F4S9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpm3Q5F4S9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms