Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf354cQ571J5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.2 ms